《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
小狐仙瑶玲失手将天国珍宝《圆梦书》散落到了人间，无奈之下，她不得不下凡寻找此物，然而，瑶玲不过只是一个六岁的孩子，凡间有趣的事情太多，她左顾右盼，几乎忘记了要寻找《圆梦书》的使命。 一次偶然中，瑶玲遇见了名为江贤的小学三年级男生，瑶玲答应江贤帮助他实现一个愿望，于是两人结伴踏上了寻找《圆梦书》的旅程。邪恶的黑狐仙亦对《圆梦书》虎视眈眈，她是瑶玲最强劲的敌人和对手。江贤喜欢上了名为瑶兰的女生，然而，他并不知道的是，其实瑶兰正是瑶玲在遇到危机情况后的变身。随着时间的推移，《圆梦书》的下落渐渐浮出水面，瑶玲最终能够完成她的任务吗？
