在上一次的风波后，已经过了一年，熏与葵的感情更加深厚，然而，他们并不知道他们即将面临他们一生中最大的考验，已经到了他们作出抉择的时刻了.......
在一个地方，宝石宠物和人类和睦的在一起生活着。这时候茱莉亚女王拜托了宝石宠物，叫他们收集魔法宝石，并且给露比等人魔法宝石箱...
在旷日持久的世界大战后，城市中遍布着出于不同原因而接受了机械化改造的人类，这些人被称为“扩张者”。与此同时，扩张技术的开发方，科技公司“贝琉连”也因战争对高科技兵器与扩张改造的需求而迅速膨胀，成为了一手遮天的巨型企业，操控着整个城市。随着扩张技术的发展，扩张者与普通人类之间逐渐产生了隔阂，也出现了许许多多的摩擦，由于过度改造而获得强大力量的“过剩扩张者”开始引发一系列社会问题，qiwan.cc成为了威胁社会稳定的重大隐患。因此，政府下辖的复兴厅设立了名为EMS（扩张者对策局）的机构用以管理与扩张者相关的事务，与称霸一方的贝琉连形成了暗中联系又相互牵制的微妙局面。在混乱的社会秩序中，故事的主角，以一把左轮手枪作为头部的过剩扩张者——乾（qián）十三以“处理屋”的身份活跃在城市中，负责接受委托并处理与扩张者相关的各种棘手案件，以此过着行走于刀尖之上的生活。而这样的生活，因为一次别有隐情的“绑架案件”发生了变化……
木叶的战士们，挺身而出吧！这是属于我们的战斗！ 云、岩、雾、砂，保护这四大国的忍者突然下落不明。而四大国因为失去了各自所拥有的血继限界忍者，便把矛头一致指向唯一没有出事的火之国。陷入疑虑与恐惧 的各大国，不排除利用发动战争来保家卫国，但如此一来，第四次忍界大战势必会因而爆发。因此，火之国的诸侯传令给木叶村，要火影务必查出事情的真相。纲手 下定了决心：「不管要付出什么代价，都要选择能够确实保住木叶村的方法」，而在这一连串事件发生的同时，卡卡西却突然宣布要脱离木叶村。「老师为什么要抛 弃我们的村子？」卡卡西所留下的「铃铛」里，寄托着他内心的信念…。在这个各自拥护忍者的大陆，五大国藉由整顿战力来维系国与国之间的和平。然而此刻，这道「危险的和平」之墙，即将面临崩毁的命运…。
