《阿优之兔智来了2》的故事延续《阿优之神奇萝卜》系列，故事讲述的是阿U和他的小伙伴们看守的那颗巨大的超级萝卜有天突然变小了，博士怀疑是巨石阵的土壤含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而现在这些物质已经受到了破坏，大萝卜得不到营养开始萎缩。博士推测萝卜岛周围的岛屿上一定还有同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们主动要求承担这个寻找土壤的任务，为了帮助大家，博士送来一只名叫兔智的机器人，它不仅智慧超群，还拥有各种能力，在保护萝卜的过程中发挥了重要作用。但是兔菲依旧不放弃自己的梦想，他带领手下跳跳和甩耳开着飞行器一路跟随阿U他们，发誓要得到超级萝卜。
超星联盟旗下的超星特工猪猪侠和菲菲、波比、小呆呆、超人强，在执行追踪星际盗贼团的任务中，落入了一个超星联盟地图上不存在的地方——空星域。这里居住着来自各个星域的生物们，因为共同的冒险精神和好胜心，这里的人们将追逐速度的星际赛车作为毕生的事业与追求。猪猪侠和伙伴们在这里收获了重要伙伴超星卜卜们，更经历了空星域赛车巡回大赛的洗礼，获得竞赛冠军，但他的伙伴超星卜卜却被星际盗贼掳到了暗星域。为了救回伙伴，更为了超星联盟的和平，猪猪侠和伙伴们进入了让超星联盟最头疼的星际盗贼活跃的暗星域。在这里，猪猪侠的超星特工小组将面对各种在超星联盟失去正式身份的疯狂份子，以及逃亡至此的危险人物，找回自己的伙伴，也将收获新的朋友，并且进一步接近星际盗贼团的最高机密——星盗实验室的真相
在未来世界里，以希特为首的一群毫无环保意识的人，为满足自己的贪欲，过度地使用高科技和自然资源，自然环境的恶化，导致无数动物陷入濒临灭绝的境地，甚至危机到人类的生存安全。 勇敢机智的孩子延羽在科学家父亲的指引和帮助下，和好伙伴林嘉静一起，从故乡金波城出发，在世界各地旅游，努力地改变着误入歧途的人类思想，在路途中，延羽结识了凌义、基洛等很多立志于保护环境的伙伴。在延羽与伙伴们的共同努力下，让大量植物碳化的绿荫市拥有了往日的绿意，使水之都的海水恢复了纯净，熄灭了炎部落的山林野火…… 最后，返回故乡的延羽与伙伴们努力抗争，感动了故乡的人民，终于阻止了希特只要科技不要环保的破坏行为，
这是众人期盼已久的完美假期。在飞往月球的豪华飞船圣芙蕾雅号上，尽情享受这难得的放松旅途——本该如此。神秘的黑影，突然的失重，消失的物品，全是漏洞的不在场证明……犯人，难道就在我们之中？
