灵气复苏，整个世界都被浓郁的灵气所覆盖，地球上的生物被此影响。人类开始觉醒，拥有更强的力量。人类以外的生物同样在灵气影响下飞速进化。一些强大而神秘的种族悄然崛起，传说位于力量顶点的便是——异皇族。机缘巧合，异皇族皇子的灵魂穿越附身在普通人类青年黄尚的身体……
飞伦、擎锋是一对热爱爆裂飞车运动的兄弟，为了实现成为冠军的梦想，两人趁着暑假时光来到疾风都市。一次机缘巧合，他们结识了神秘的爆裂飞车——风暴猎鹰，然而没等他们搞清现状，自称黑暗战士的爆裂飞车却出现了。它们企图利用爆裂联盟大赛上所收集的纹章晶片打败光明战士。为了阻止它们的阴谋，飞伦、擎锋毅然决定参赛。然而在两人克服重重困难的过程中，他们却发现敌人的阴谋远不止这么简单——它们居然妄图控制整个宇宙！决定宇宙未来，光明与黑暗的斗争将在爆裂夺晶争霸赛上拉开序幕
为从美杜莎女王手中夺取异火，萧炎在药老陪同下前往蛇人族居住的塔戈尔沙漠。却因口渴误闯绿洲，引来蛇人族高手月媚追杀。没有药老逆天协助的萧炎，眼看要被月媚杀死，生死存亡之际，幸得一位蒙面斗皇相救。不料蒙面斗皇一行人也为异火而来。美杜莎女王拒绝古河交换异火的条件，蒙面斗皇戳穿女王此刻是能量体，而真正的女王在某处准备吞噬异火，进化为斗宗。蛇人族攻击冒犯女王的古河等人，萧炎也在混战中感知到异火行踪，潜入女王所在的地心岛……
导游事业屡屡不顺的光头强偶然捡回丢失的缩小手电筒，为吸引游客他建造了一个微观乐园。正当他带着缩小后的两熊去体验微观乐园时突遇暴风雨，缩小手电筒意外丢失了……
《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
