在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
时代的流淌逐渐泛起波澜。 乱世中，为野心而养精促锐者、企一展雄图者、为该守护之物而战斗者…… 这样，拥有不同梦想的人被命运的蚕丝牵结。 缔结成姊妹的关羽和张飞。 究竟，有何物在其前行之路上等待着呢？ “吾名为关羽。与吾一起平定此乱世吧！”
纱仓响（法伊鲁兹·爱 Fairouz Ai 配音）是一个对美食非常热衷的女子高中生，从来没有考虑过饭量和身材之间的关系的响，因为某一天被朋友说长胖了而整个人生都受到了颠覆。夏天眼看着就要来了，不能再这样下去了！纱仓响决定开始健身，而仅凭一己之力想要坚持下去是很不容易的，于是，纱仓响来到了健身房。 运动万能成绩优异的学生会长奏流院朱美（雨宫天 配音）、温柔体贴的上原彩也香（石上静香 配音）、虽然身为俄罗斯留学生日语却非常流利的吉娜·波特（东山奈央 配音）、拥有着不为人知的秘密的教师立花里美（堀江由衣 配音），在健身房里，纱仓响很快就交到了朋友。
彼得（下野紘 配音）是隶属于亚格巴契战士公会的战士，曾经在武斗祭上夺得头筹，被誉为地表最强人类。彼得的最大梦想就是能够成为世界上最强的男人，然后迎娶自己的青梅竹马露薇莉亚（二之宫唯 配音），现在，他离实现梦想仅剩最后一步了。 然而，让彼得没有想到的是，自己所拥有的强大力量和高涨的人气吸引了各族女子慕名而来，她们都想获得继承了这强大基因的孩子。古灵精怪的鬼人族姐妹莉莎（山村响 配音）和美美（竹达彩奈 配音）、性格高傲总是拿鼻孔看人的高等精灵薇绀（上原明里 配音）、个性非常内向，总是缺乏自信的兽人皮格莉特（千本木彩花 配音），这些女子们为了争夺彼得的种子开始了较量。
大部分的人类，在这个时代里都拥有名为“个性”的力量，但有力量之人却不一定都属于正义的一方。 只要邪恶出现的地方，必定会有英雄挺身而出拯救众人。 一名天生没有力量的少年——绿谷出久从小就憧憬一位顶尖英雄，而他的梦想就是成为伟大的英雄， 可是，没有力量的他能实现自己的梦想吗？ 虽然困难重重，少年却依旧不放弃，朝着自己的目标勇往前进！
丹尼斯的双亲是未受到社会支持的疯狂科学家。他们将自己的孩子监禁在孤岛的研究所，进行秘密实验，将除丹尼斯以外的一个哥哥和三个姐姐改造成了特异的人类。 某天，双亲遭到警察逮捕，由此五兄弟姐妹被福祉单位移送岛了别的岛上。 问题是，除主人公以外的四名兄姐， 没有一人拥有现代人的常识……
