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　　人类遭逢了名为“空间震”的新型灾害。震撼空间、将一切破坏殆尽的这一灾厄，是由于精灵自临界显现而发生的。为了阻止空间震，使人类免遭灾厄而必须采取的措施，是使用武力歼灭精灵，或者是——“与其约会，使其娇羞”！                                    
                               　　让精灵娇羞，再通过“亲吻”即可封印其力量——拥有这种能力的高中生·五河士道。为了人类的和平，也为了拯救精灵们——士道在和她们的“约会”中来回奔走。对士道敞开心扉的精灵·十香、四糸乃、琴里、耶俱矢、夕弦、美九，为歼灭精灵而行动的AST，企图利用精灵的DEM，尝试与精灵对话的拉塔托斯克，以及，需要令其娇羞的新精灵——将这一切全部卷入，新的战争约会开始了——                         

拿到这本由死神路克所掉落的死亡笔记本的人，是日本的高中生“夜神月”。月将世界上一个个犯罪者的名字写进笔记本上杀掉，他相信这样的行为会是正义，誓言要将世界变成一个没有犯罪者的新世界，而他将是这个新世界的神。发现有人在制裁犯罪者的一般民众，开始称呼这位制裁者为“奇乐（KIRA）”（KIRA为Killer的日文拼音，意思是杀手。）另一方面，察觉到奇乐出现的ICPO（国际刑警组织，Interpol），委托一个名为“L”的侦探来调查奇乐事件。L是唯一能动员全世界警察的人，世界上很多陷入胶著的案件都是由他查出。他的本名、长相、居住地等，完全没有人知道。认为奇乐是罪恶的L，用巧妙而大胆的方式证明出“奇乐你就在日本关东地区”，在日本设立搜查总部挑战奇乐。奇乐和L，从此为了揭露彼此的真面目，也为了彼此的正义展开了一连串的斗智。

从乡下转学到都市学校薰风高校的小山田耕太，在转学首日被传说中学校第一美少女源千鹤叫出去，受到她的热烈告白，同时得知她不为人知的秘密。从那天起，妖怪(千鹤)和人类(耕太)间便开始了热烈的交往。

高中生夏目貴志有靈異體質，能看見別人所看不到的。當他得到祖母玲子的遺物「友人帳」之後，不論白天或晚上，開始有各式各樣的妖怪紛紛找上門！ 原來玲子也和貴志一樣有靈異體質，大家都對她敬而遠之。玲子因為十分寂寞，便到處向妖怪下戰書，並要戰敗的妖怪交出名字，訂立服從的契約。而貴志拿到的，正是這本寫有眾多妖怪名字，能夠號令百妖，力量引人覬覦的「友人帳」！ 貴志在得知事情原委之後，決心要將「友人帳」上的名字一一還給被玲子擊敗的妖怪。而想要不費吹灰之力拿到友人帳的妖怪「貓咪老師」，則自願當保鑣，保護貴志和「友人帳」，共同踏上妖怪之旅！

　　千叶县立总北高中的新生小野田坂道（山下大辉 配音）是一个地地道道的动漫宅男，他身形瘦小，貌不惊人，动漫元素占据了他的脑瓜。无奈初中时代没遇到任何同好，好不容易升上高中，却发现梦寐以求的动画研究部因人数太少而废部。这个与周遭格格不入最喜欢蹬着自行车前往45公里外的宅男圣地秋叶原购买新出的游戏和手办，在人烟稀少的坡道上哼唱动漫主题歌是他无比惬意的时刻。偶然机缘，他结识了为打败宿敌御堂筋翔而艰苦训练的自行车竞技选手兼同级生今泉俊辅（鸟海浩辅 饰），其骑着淑女车轻松爬坡的样子令后者大为震惊。看似没有任何优点的小野田，以此为契机加入了高手云集的自行车竞技部，全新的青春之门为他打开……                                    
　　本片根据渡边航的同名原作改编。

　　為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。