小黑怪等黑暗势力的计划屡次被星猫和他的伙伴们粉碎，黑魔王大发雷霆。为了尽快搜集更大量的精神之光来解开自己身上的封印，黑魔王焦急地授意小黑怪去破坏孕育中华民族五千年文明的河流，并一路毁坏那些跟中华文明有关的事物。同时星猫带领的宇宙警卫队察觉到黑魔王的这次阴谋，决定阻止他们的破坏行动，保卫中华文明的发祥地，维护世界的和平。正义与邪恶的较量即将展开，到底小黑怪等黑暗势力会使出怎样邪恶的手段与阴谋，我们的星猫和他的外星伙伴们又该如何面对呢。
【bilibili出品】《小绿和小蓝 第二季》最新PV上线！“魔王世界与人类世界势不两立，魔王小绿和骑士团团长小蓝该如何消除隔阂，化险为夷？快来与@小绿和小蓝动画官方 一起看番吧！ 出品：bilibili、腾讯动漫 制作：@大火鸟文化
勇敢的男孩小宏接触到魔幻元珠，成为了充满正义感的元珠能力者，他和来自不同时空的少年能力者以及幕后技术智囊们一起，带领盟卡伙伴守护城市和人们。新一季里，自私的外星反派为了复苏自己时空的黑洞行星，不顾大地的安危夺走大量魔幻元珠，引发各种灾害。小宏团结伙伴们一起挺身而出拯救危机，在此期间他们了解到黑洞行星的过去，也用真诚让反派阵营的两位少年能力者逐渐醒悟而成为正义的伙伴，让大地和星际时空重现和平与安宁。
古神之地后，修魔内海永夜魔城一夜崛起，为拓展领地，不断对修魔海周边宗门下手，其中也包括了李慕婉所在云天宗。李慕婉在护门大战中身中奇毒，性命攸关，王林得知此事后，携其再次闯入修魔内海，王林以化神初期修为力战三大城主，名震修魔内海，带回解药救下李幕婉，却发现危机并未解决，千年阴谋浮出水面。最终凭借二人情愫及化神后首次与古神之身合体，联手斩灭魔尊。
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象：森林树木变得更茂密，湖泊海洋闪发着光，电力强化导致设备爆炸。由于基因源事故，武装战士变成变形机甲、生物进化为虫族、浩肯星人异化为变异战士，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
在山海奇境的故事中，阿凉通过祠堂的神秘画卷结识魔法王妃，领悟了魔法凉帽的精神。在海底帮助小动物时，发现珊瑚秘境里有人类在山中生活的遗迹。与此同时，魔法王妃给阿凉预示，海洋即将遭遇危机。黑商利用海灵珠，操控海灵掠夺各种奇珍异宝，导致海灵失控灾难频发，海底世界一片破败，凤凰山秘境也动荡不安。在魔法王妃指引下，阿凉在秘境森林里发现了海洋文明的遗迹，明白了山海相连、自然平衡的秘密。阿凉秉承魔法王妃的精神，凭借勇气和智慧归位海灵珠，成功阻止灾难发生，凤凰山和海底恢复生机。
