故事讲述两派来到地球后，因为发生了一些“事件”，导致双方外形大变（也解释了两系列风格不同的原因）。也由于这些“事件”，变形金刚要隐藏于人类社会之中。如何去平衡一切关系是擎天柱作为领袖将要面临的考验，本作品的标题也由此而来。 值得一提的是，本次两派领袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久违的梦幻组合：来自初代动画的 Peter Cullen 和 Frank meijubar.net Welker！他们在阔别电视版的变形金刚作品多年后，再次一起回来共演这双经典的死对头！
剧集集合了复仇者联盟的众多经典成员。在世上最危险的超级坏蛋从四大监狱:穹顶(Vault) 立方体(Cube) 巨室(Big House) 木筏(Raft)逃出后，地球上最伟大的六个超能英雄自发组成了自由战斗联盟:复仇者联盟。他们与邪恶势力顽强战斗，成员包括Hank Pym(蚁人和巨人的复合体)、美国队长、绿巨人、钢铁侠、雷神索尔和蜂女，黑豹和鹰眼在随后的剧集发展中也会加入进来。当一个英雄的力量无法拯救世界时，就是整个英雄组合出场的时刻。
裁判官死后，幽灵号船员和其他义军单位取得了联系，一位名叫阿索卡的新盟友出现了。但随着邪恶的达斯·维德来到洛塔，局势再次紧张起来。
King Sombra曾经统治小马国边缘的水晶王国，带来了无尽的苦难。后来他被塞拉斯迪亚公主和露娜公主联合击败，变成阴影，并被放逐。 一千年后，King Sombra卷土重来，想要重新统治水晶王国。大公主希望暮光闪闪一行去保护水晶王国，免受King Sombra的再度袭击。他们克服重重困难和阻挠，去保护水晶王国，并让那里再度恢复生机。
二战后铁幕下的拉脱维亚，导演自传作品，以可爱动画、真人及历史片段，拼贴出一个难以磨灭的黑暗童年。如所有在冷战期间于苏联长大的小孩，女孩每天被恐惧支配，极权政府长年累月进行洗脑式教育，生活就是无处不在的政治宣传。直至一天，女孩发现了长埋后花园的德国士兵，才令她怀疑，在「热爱祖国」的表象下，还有什么真相静待被发掘出来？
