在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
伊莱克斯的传奇史诗，重现伟大的死灵圣法神·亡灵天灾伊莱克斯的荣光之路。 从光明信仰走出后，是对束缚的破壁；又在枷锁下被冲击，是时代再一次的闭锁。 原本身为天之骄子，但在帝国利益间伊莱克斯成为威胁统治的存在，随后国家与教廷利用他的爱人将其算计，并毫无犹豫的决定抹杀，最后伊莱克斯凭借一己之力重创这个背叛他的世界，造就了一代传奇。
科研潜艇“逗号”，是科幻小说《地心游记》的铁杆粉丝。为研究海底神秘物质, 跟着叔叔地质学家 “铁石号”深潜马里亚纳海沟，意外被卷入洞穴迷宫来到巨大未知世界并发现远古生物，开启了超乎想象的海底地心探险。
新的一年，全新好玩的故事在青青草原上演，这一次的主角是“好吃懒做”的懒羊羊（梁颖 配音），他将和好朋友与新伙伴们做出一道道美食，和小朋友们度过快乐美味的时光。 羊村建成了新厨房，村长（高全胜 配音）做出了很多好吃的姜饼分享给羊羊们。懒羊羊夜晚偷吃姜饼，无意间打翻了调味盒，谁知竟导致灶台下滋味王国的剧烈动荡。来自该王国的上学五宝棒棒、健健、康康、欢欢和乐乐要寻找跑走的姑奶奶（严彦子 配音），因为姑奶奶掌控着王国的各种滋味。麻烦的是姑奶奶住进了灰太狼（张琳 饰）的家，根本不打算回去。无奈之下，懒羊羊只能和伙伴们构思各种各样的美食，希望姑奶奶能够满意地回到她的国家……
巴斯沉入海底之后，被忠实的手下夸克救出。新的一届陀螺大赛开赛了，本次的奖品是基因块。巴斯为了夺得基因块，创建了陨石队，一同大战劲爆战队。他们在试炼之岛，和各国高手大战，巴斯的新队员实力非常强大。他们的陀螺全部升级为第二代。
