老夫老妻重返青春

　　1989年，日本。
　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。

　　小学校５年生の四葉こころは、ちょっと不器用だけどやさしい女の子。「モノにはみんなたましいがある」というおばあちゃんの教えを守り、モノを大切にしている。ある日、こころが大切にしている色エンピツからモノのかみさま・ここたまが生まれた！名前はラキたま。ここたまには人に見つかってはいけない決まりがあるが、ラキたまは生まれて早々こころに姿を見られてしまう…

伊莉雅是一个就读穗群原学园的普通女孩子，在某天遇到了自称人工天然精灵的魔法露比万花筒之杖，并强制地被缔结契约，成为了魔法少女伊莉雅。而已是红宝石之星持有人的她，还变成了万花筒之杖原持有者的魔术师远坂凛的奴隶，在其的命令之下，被迫帮忙回收沉睡于冬木市的某危险的卡片……

　　突然出现在人类面前的神秘飞翔体“灾”。                                    
                               　　意味着灾厄的此一存在凭借异样的战斗力凌驾于所有的航空战力之上。                                    
                               　　为对抗他们而开发的，便是对现有机体进行特别调整以实现超水准高机动力，                                    
                               　　被称为“子体”的兵器。                                    
                               　　负责操控的则是名为“阿尼玛”的操纵机构。它——竟拥有少女的外表。                                    
                               　　因“灾”的缘故而失去驾驶员母亲的少年“鸣谷慧”，                                    
                               　　他遇见了闪耀鲜红光辉的瑞典制战斗机以及驾驶它的阿尼玛“格里芬”。                                    
                               　　身为人类最终兵器却动作不稳定的格里芬，还有一心向往天空的少年，                                    
                               　　两人漫长且炙热的故事就此展开。