基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
天下第一剑客盖聂（刘钦 配音），带着已故挚友的儿子荆天明（冯骏骅 配音），一路颠沛流离，只为了躲避秦王的追杀。在以一人之力击退了秦王派出的三百骑兵之后，荆天明在盖聂的身上看到了真正的侠肝义胆。此事传到宫墙之内，秦王大怒，命令宰相李斯（游军 配音）一定要将他们两人除之而后快，于是，李斯找到了盖聂曾经的同门师兄手下败将卫庄（吴磊 配音），想借他之手，完成自己的使命。 卫庄派出了手下四大天魔王一路袭击盖聂，而盖聂和荆天明则获得了少羽（沈达威 配音）、高月（黄怡晴 配音）和墨家众人的鼎力相助，屡屡死里逃生。最终，卫庄将盖聂一行人逼至绝境，只为了能够再同他比试一场。
2015年10月21日，英国银色之门媒体公司宣布将与中国中央电视台联合开发全球知名儿童海洋探险动画《海底小纵队》第五季。签字仪式于当天下午在英国文化部举行。中国中央电视台副总编辑李挺作为代表与英国银色之门媒体公司副主席威廉·阿斯特签署了动画片《海底小纵队》第五季联合制作谅解备忘录。英国文化、媒体和体育部政务大臣艾德·韦泽主持并见证了签约仪式。这是中央电视台首次与西方动画公司合作开发一部学龄前儿童作品，银色之门媒体公司将提供动画剧本和音乐创作，制作部分则由中央电视台全权负责。 动画片《海底小纵队》第五季从2020年12月28日起在中央电视台少儿频道开播。
在一个美丽祥和的海岛上，有一群健康可爱的蔬菜，大家在萝卜村长的带领下，过着幸福而又快乐生活。可是神秘邪恶的基因博士在入侵了世上大部分地区后，将下一个目标瞄准了蔬菜家园，他派遣了一群变异动物去对付蔬菜们。阳光正义的小番番，善良可爱的洋葱美眉，无厘头爱恶作剧的萝卜特，脾气火爆的火辣辣，超级大吃货小胖豆……蔬菜们将使用各自神奇的技能，反抗动物们的入侵和破坏，保卫自己的家园。
石距危机解除后，SSR班迎来了新伙伴，显得更加热闹了起来。而此时适逢百鬼幼儿园举办的春日祭，玉藻前和妖刀姬摆摊卖起了章鱼丸，阎魔、判官和小黑小白兄弟搭起了鬼屋，然而全校最红火的当属SR班的弈同学，他开的竞猜让全校师生输光了小妖怪却又欲罢不能。但在此时，有个饥寒交迫的身影倒在了校门口，发现情况的同学们都热心的对他伸出援手，可是这个孩子出现后发生的种种事件，为他的身世带来了重重的谜团......
