香月舞（小幡洋子 配音）是小学五年级的女生，她梦想着能够成为一名出色的魔术师。小舞的祖父经营着一家魔术剧团，小舞从很小的时候开始就在那里帮忙表演了，可即便如此，小舞还是觉得生命里始终缺了点什么，自己距离成为魔术师的梦想仿佛还有很远很远。 一次偶然之中，小舞在机缘巧合之下遇见了拥有神奇魔法的镜子妖精，在镜子妖精的帮助之下，小舞也拥有了魔力，能够变身成为天才魔术师爱美。凭借着这神奇的魔法，小舞很快就成为了圈内著名的魔术师，甚至还受到了电视台的邀请，邀请她上电视表演。
故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。
人类没有了咏唱，就不能使用魔术。但是，有一个少女，把不可能变成了可能。利迪尔王国魔术师的巅峰七贤人之一沉默的魔女莫妮卡埃瓦雷特。是史上第一个创造出无咏唱魔术的年轻天才。但是因为极度怕生而怯场的她，和使魔黑猫躲在深山里，被公式书包围着，静静地埋头于魔术的研究。在这样的情况下，七贤人的同事结界的魔术师路易斯米莱来访。
みつけた、熱くなれるもの（魔法少女）をー 祖父のもとを訪れた地図子は、街を守る魔法少女・ベリーブロッサムと出会い、たちまち夢中に。 しかし、敵対する悪の組織「フォッサマグナ」総帥・クロマの攻撃があまりにもパッとせず、２人の戦いは見応えゼロ。もっと、ベリーの活躍を愛でたい地図子はモヤモヤを募らせていく・・・。 「魔法少女をもっと輝かせたい・・・強いてくれ、苦戦を！」 その欲望（？）が、内気な少女を悪の路に導いてゆく―。
在一个晴朗明媚的日子里，自称废柴的学生君逆回十六夜（浅沼晋太郎 配音）、温柔善良爱护小动物的春日部耀（中岛爱 配音）以及高傲自大的大小姐久远飞鸟（布里德卡特•塞拉•惠美 配音）各自收到一封邀请函，信中说道：“告知烦恼众多、拥有异能的少男少女，如果期望一试自己的才能，那么就抛弃世上的一切，到我等的‘箱庭’来”。原来他们三人均为拥有超能力的问题儿童。似乎接受了邀请，他们被抛入风景秀美的箱庭世界，并遇见说明人黑兔（野水伊织 配音）。十六夜他们得知，必须运用天赐的特异功能在箱庭进行难度不等的神魔游戏。不按常理出牌的主人公以及藏着无数秘密的箱庭，一切变得好玩起来…… 本片根据竜ノ湖太郎（文）、天之有（插画）的原作改编。
為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。
