诸神陨落已久，继承“神祇烙印”的灵能者们退居一隅，普通人们安居乐业，逐渐忘却了那些神明的故事。 少年戚歌过着平凡的生活，可他的命运因为一把神秘黑刀而改写，"灭世魔神"路西法竟寄居在他体内，未知的灵能世界逐渐在他面前展开。 命运会将他引向何方呢？又或者，这命运能否由他自己来主宰？ 曾经的“诸神黄昏”到底为何发生，错综的灵能势力里谁才是真的正义？ 为了掌握自己的命运，戚歌与同伴们一同踏上超越诸神的成长之路……
今鸟星，以国家为单位组成的庞大星球。大国之间常因争夺领土而开战。实力强大的厉国合虚合国开始争夺领土，厉国最强组织“刺”的成员——罗格格多（男主父亲）被指认为叛国者，导致罗格自幼和母亲备受欺侮，丧失立锥之地。在和同伴的斗争中被“刺”成员百鸟凰救下，并受百鸟凰指引进入世界上最混乱，最恐怖的恶人学院，进行修习历练，同时寻找世人口中父亲叛国的真相。而在恶人学院和拥有强大战灵的对手抗争中，罗格被激发出最神秘的黑色“战灵”却无法自控，后由落日学院副院长进行压制，然而罗格对自己体内的神秘...
灰太狼费尽心思创造出各种发明来捉羊，却屡次失败。于是灰太狼来到发明星球，去抢宇宙级大发明家——妙多多发明的发明战车聚宝号来捉羊。慢羊羊得知后，准备造出另一个聚宝号对付灰太狼。但由于慢羊羊是普通发明家，不仅失败，还因此失去了发明能力。于是，小羊们也来到了发明星球。 一踏上发明星球，小羊们就被星球上不可思议的人和事所吸引：发明星球卧虎藏龙，居民都拥有自己专属的发明能力，是某一领域的发明高手。 小羊们通过新闻找到了妙多多，但聚宝号已经被灰太狼给抢走了。妙多多便给了小羊们他的另一辆发明战车——妙宝号来对抗灰太狼的聚宝号。由于聚宝号和妙宝号没有发明星球的能量来源——能量之芯，无法发挥最大功力。灰太狼便想尽各种办法，创造出各种发明来抢夺能量之芯。羊羊们便用妙宝号阻止灰太狼。妙多多还告诉小羊们只要妙宝号用发明帮助别人，积蓄能量，再配上能量之芯，可以使慢羊羊回复发明能力。于是，小羊们开始发挥奇思妙想，用发明解决居民们的花式求助。
《熊熊乐园3》在原有寓教于乐、制作精良的基础上，加入了“毛毛父亲”等一系列新角色，亲子主题贯穿整体故事，进一步满足了粉丝全家其乐融融一起看的需求。
