伍六七接到神秘任务过程中却意外丧失记忆，为了唤醒记忆，伍六七去到过往记忆发生的地方见到记忆相关的人，其身世之谜也随之逐渐浮出水面。
凌亮和陈凯来到上海市，3A高手林小志答应加入烈火队。姚杰来到北京市，认识了翁婆婆的孙子李向阳。在姚杰帮助下，李向阳被姚杰的真诚所感动，祖孙俩的误会终于解开。凌亮在回江川市途中与队友失散，来到乌镇并结识了岳靖，更遇到了银鹰队的罗宾与何顺。姚杰来到济南市，遇到精通5A的马丽娜并邀请她入队。世界大赛备战期间，凌亮揭穿了马丽娜的阴谋。烈火队最终凭着昂扬的斗志与技术，成为第一支夺得世界悠悠球全能赛冠军的中国队伍。
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象：森林树木变得更茂密，湖泊海洋闪发着光，电力强化导致设备爆炸。由于基因源事故，武装战士变成变形机甲、生物进化为虫族、浩肯星人异化为变异战士，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
