最弱技能《果实大师》～关于能无限食用技能果实（吃了就会死）这件事～

　　一次意外中，少年弘濑琢磨（小清水亚美 配音）的双眼失去了光明，这为他内向的性格更增添了一层阴影。父亲将琢磨托付给乡下的叔叔代为抚养，同时也希望乡间闲散的生活能够治愈他受伤的心灵。在乡间，琢磨结识了个性活泼开朗的姐妹神乐萤（成濑未亚 配音）和神乐雏田（田中凉子 配音），这一对姐妹乐观的态度让琢磨的心扉敞开了不少，同时，班级中的田端唯（安田未央 配音）等同学也令琢磨暂时忘却了痛苦。
　　与此同时，那个叫做小日向早美（樱井浩美 配音）的女孩出现在了琢磨的视线中，由于家族的缘故，早美只能隐居在深山之中，接受居民们的憎恨和排斥来替家人赎罪。早美的坚强感动了琢磨，在两人的努力下，同学们也逐渐的接受了早美的存在。一切都看似往好的方向发展，直到村长说出了那个和早美有关的，足以摧毁琢磨灵魂的秘密。

　　某天突然出现了一个神奇的按钮。按下按钮后，就转移到了另外一个异世界！！                                    
                               　　从其他世界转移而来的角色们在那里大集合……！？ 

　　讲述了“柱”突然出现在地球上，威胁着各种生命。人类对其束手无策并被逼入绝境，此时成为“奥丁”的神向人类伸出了援手。奥丁将女武神“瓦尔基里”以及成为她们羽翼的英灵机作为反抗“柱”的手段授予人类，并宣言反击。                                    
                               　　数年后，在人类与“柱”持续战斗的天空中，身披战翼的女武神们以及支援者女武神的男人们，为了拯救世界而拼上性命翱翔天际。日本也不例外，与耸立于灵峰富士的巨大柱对峙的3名女武神。她们每个人都具备强劲的能力，但却都是些问题儿童。此时，一位王牌飞行员因某些缘由从欧洲前来……                                    
　　“来吧，是反击的时候了，人类。终将来临的决战之日——诸神的黄昏已近在眼前。”                         

　　延续TV版的主线剧情，继续讲述从战场回来的少女薇尔莉特·伊芙加登为了理解“爱”的含义而从事为有需要的人们写信传情的工作。薇妹一直挂念的少佐的下落大概率会在这部剧场版中讲述。

曾经，因为不满宙斯的残暴统治，由麒麟由达（石田彰 配音）和凤凰路卡（绿川光 配音）带领的天使们开始了反抗天界的叛乱。作为敌对方，天界派出了青龙豪（森川智之 配音），玄武真（樱井孝宏 配音），朱雀礼（宫田幸季 配音）和白虎凯（吉野裕行 配音）四圣兽来镇压叛乱，最终，由达和路卡被封印，而四圣兽也因为各自的原因而封印了能力流落到人间。                                                                      　　故事从四圣兽打破封印的时刻开始，一股来自地狱的邪恶力量正在危害人间的和平和安全，为了保护世人，四圣兽决定重新开始漫长的战争。而站在这股邪恶力量背后的，正是他们曾经的伙伴和敌人——由达和路卡。

　　圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。
　　参加圣杯战争的7名由圣杯选出的魔术师被称为Master，与7名被称为Servant的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵，被分为七个职阶，以使魔的身份被召唤出来。能获得圣杯的只有一组，这7组人马各自为了成为最后的那一组而互相残杀。
　　卫宫切嗣的养子卫宫士郎，偶然地与servant中的剑士Saber（セイバー）订定契约，被卷入圣杯战争当中...