门派废徒叶辰，被赶出宗门，无以为家，机缘巧合之下偶得真火，再踏仙武之路。 这是一个神魔仙佛并立的世界，这是一个诸天万域混乱的年代，叶辰的逆天征途，由此开始，历经磨难和轮回，最终问鼎大道巅峰。
《木奇灵2圣天灵种》是武汉博润通公司制作，心田动漫文化传播有限公司编剧的国产动画片。该动画片是一部乐趣科普片，是一部快乐成长史，是一个人与自然和谐共生的快乐王国，具有“植物、人文、连接、全产业、向世界”五大精髓，以深度融合共赢突破了动漫界限，与多领域伙伴一起创造一个涵括 文化、人文、科技、产业为一体的情感世界。 由于人类的扩张对水源造成破坏，最终导致海洋受到严重污染，海洋中的巨藻木奇灵摩天因为无法抵抗海洋污染的侵蚀，选择利用污染的黑暗元力开展报复计划，一种叫“赤华”的植物开始在人类世界和绿影岛上疯长，危机瞬间爆发。滨江之城的小学生洛飞、浩磊、凌天恒回到了绿影岛，和绿影岛的灵希公主以及他们的契约木奇灵一起寻找一颗传说中拥有强大净化能力的圣天灵种来应对赤华危机。当洛飞等人经过重重考验成功得到圣天灵种后，不仅要对抗摩天一方制造的麻烦，还要面对同伴之间的摩擦与误会，但洛飞没有退缩，带着伙伴们踏上前往深海之都的旅程，最后成功击败摩天，净化赤华，消除了危机。
金阳原本是一个普通少年，有不少小毛病，但他有十分积极的心态、助人为乐的品格和不怕困难的勇气。一个偶然的机会，他参加了武当山太极学院夏令营，认识了年纪相仿的朱焰、蓝岳等人。校长静虚发给孩子们一些神奇的校徽，据说它与太极能量——元力息息相关。不料，此事被武当的千年对手影山得知。影山尊者发誓夺下武当山，派出手下不断刺探消息，骚扰攻击太极学院。金阳、蓝岳、朱焰等七位少年运用所学的知识，修炼的能量和“千年水滴”赋予的元力，与影山斗智斗勇，大家共同成长，逐步激发了内在的天赋，成为七彩“虹少年”。最终，他们和老师以及校长齐心合力，开启了真虹灵柱的能量，战胜了来犯的影山。
数百年前，一场突如其来的陨石群撞击，让整个世界崩塌成两片彼此共生又绝对隔离的大陆。为了拯救危在旦夕的人类文明，数百位以罗森博格为首的原大陆科学家，集诸国之力研发出一种新型能源供给装置（卡片）。主人公陈暮从一个弱小无助、贫苦无依的困顿少年，在经历了一连串充满挣扎与磨难的冒险之后，没有放弃与退缩，依然靠着善良包容的天性、自身的卓绝努力与周围亲朋好友的热情相助，最终突破重重障碍，成长为一个正义凛然、以德服人、能力出众的正面领袖的故事。
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
娆疆一行归来，李嗣源已称监国，借天子之名四处绞杀不良人，而身为天子的李星云也即将面临一个新的选择……
在现实生活中只是平凡小孩的男主人公小特和女主人公小菲，在梦境世界里却是守护梦想的“超级英雄”。他们带着拥有特殊能力的梦精灵进入到孩子们的梦境中去，化身战士对抗想要扭曲孩子们梦境，获取恶梦力量的梦魔，阻止梦魔统治梦境，为孩子们守护快乐而美妙的梦想世界。该动画每集都会有孩子被梦魔魔拉的恶梦力量所影响，对自己的梦想失去信心，而主人公小特小菲就会在博士的帮助下进入孩子们的梦境，打败梦魔，重新获得梦想。正反派间的激烈对决，幽默搞笑的故事情节，让小朋友们在观看动画片的过程中能感受到正义、友爱、梦想的力量。
