为从美杜莎女王手中夺取异火，萧炎在药老陪同下前往蛇人族居住的塔戈尔沙漠。却因口渴误闯绿洲，引来蛇人族高手月媚追杀。没有药老逆天协助的萧炎，眼看要被月媚杀死，生死存亡之际，幸得一位蒙面斗皇相救。不料蒙面斗皇一行人也为异火而来。美杜莎女王拒绝古河交换异火的条件，蒙面斗皇戳穿女王此刻是能量体，而真正的女王在某处准备吞噬异火，进化为斗宗。蛇人族攻击冒犯女王的古河等人，萧炎也在混战中感知到异火行踪，潜入女王所在的地心岛……
金晨曦篇主要讲述杨蔑和翠玉鸣鸾的故事，以此牵扯出圈外的另一种生物金晨曦，圈外深处并不只有黑狐娘娘。金晨曦是一种似人非人的圈外生物，有着非常强的实力，还是三少亲自动手解决的，可是并没有斩除后患。
云青岩为了化解新的危机，拜入了天元王朝十大学院之一的星空学院，在这里他结识热血兄弟苏图图，同时也得罪了天元王朝最顶尖的三大天骄！不过云青岩凭借仙帝手段，镇压了一个又一个敌人，化解了一次又一次的危机。当他有一天，回首过去的时候，他已经站在了天元王朝的巅峰。此时的云青岩，眼中看到的，早已不是小小的天元王朝，而是那浩瀚无垠的星辰大海。
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
