末法历2020年，因为魔法元素枯竭而走到了文明尽头的斯特恩大陆，在虚空风暴下迎来了大陆的毁灭。 大陆最后的法神叶玄，意外苏醒在了三千年前魔法文明鼎盛的时代，成为了大陆西北奥兰多王国边境西斯魔法学院的一名普通学生。 为了拯救大陆，让末日不再来临，叶玄开始探寻三千年前导致大陆魔法元素枯竭的黑暗动乱之谜，阻止大陆危机。 精灵族、巨龙、比蒙、兽族……一个个鲜活的种族，蓬勃的生机，辉煌的大陆，让叶玄愈发的清楚自己的使命。 万界法神，这个美好的世界，这一世将由我叶玄来拯救！
三界皆惧的隐族尊主禾莞突袭天庭，上神南泽迎战，种玉小仙虞之瑶为保护南泽，舍命相救，与禾宛玉石俱焚之际意外重生，阴差阳错虞之瑶重生入了禾宛之体，重生后的禾宛隐之力大损，西海隐卫听昭前来帮助尊主禾宛恢复隐之力，之瑶自此被迫开启了双面女尊之路，人前佯装威严，君前娇俏可人……
即《偷星九月天之童年故事》之后的又一部《偷星九月天》动画作品。中二少年（少女）们的无节操校园日常、脑洞大开的各种诡异课程、VV侦探学院魔鬼老师与BT校长，各种暗恋与秀恩爱的美好至极的学生生活（三月四月你们够了喂！）尽在《偷星九月天Q》第二季。
