本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
九霄大陆一代灵宗百里云霄，死后重生都市年少之时，改写人生，重登世界之巅，重返学堂，拾起年少轻狂，一手绝世医术，一身至尊功法，一生挚爱相随，勇斗富少，揭露黑医，国难当头冲阵在前，以重生之躯，再闯九天云外，报血海深仇。
在异世生存十年的幸存者左天辰去回到了一切悲剧开始的那天； 外星生物入侵，携带细菌武器而来，四处攻占人类家园，地球上的人们都被细菌所感染。 左天辰知道，未来的时光会无比的艰难，但为了前世的伙伴和亲人他必须活下去，并且变得更强来保护和拯救身边的人…… 这一次，我要弥补所有的遗憾，这一次，我要守护家园！
佟湘玉（闫妮 配音）身为同福客栈的掌柜，却有着不一般的身世和不为人知的过去，她眼观六路耳听八方，为人处世圆滑又不失分寸，是一位能够掌控大局的老板娘。白展堂（沙溢 配音）曾经是江湖传说中的盗圣，如今金盆洗手，成为了客栈的跑堂伙计，为人耿直善良的他和佟湘玉渐渐走到了一起。 郭芙蓉（姚晨 配音）平日里大大咧咧，冒冒失失，但有着一颗痴情而正直的心，她满心里想着的，就是和毒舌秀才吕轻侯（喻泰恩 配音）一起双宿双飞，过上日出而作日落而息的幸福生活。小小的同福客栈之中藏龙卧虎，众人在打打闹闹之中撞破了一个惊人的阴谋，在武林之中掀起轩然大波。
太虚幻境——与人类现代社会平行的异世界，在那片广袤的土地上生活着人、佛、神、魔四族。佛族的三藏法师因为与女儿国国王约会而受到佛族与神族的诛杀，他的弟子齐天、天蓬、悟净为了保护师父，不惜与诸神开战！
该片讲叙了虹猫、蓝兔在开心国的奇妙识字旅行。虹猫、蓝兔在一次野外识字游戏中，从一群蚂蚁手中救下了神奇的字魔方，他们得知字魔方要找回因蚂蚁国进攻而失散的字卡，决定帮助字魔方。一段寻字、识字的旅程开始了，开心国的小王子乐乐、蚂蚁国的小公主六六先后加入了虹猫、蓝兔的队伍。四个孩子克服了重重困难，终于找齐了以笔、墨、纸、砚四大字精灵为首的全部字卡。蚂蚁国也与开心国重修旧好，幸福和快乐又回到了这片土地上。
