数学荒岛历险记3是《荒岛历险记》数学系列的第三部作品，是一部凝合了数学科普教育与少年励志为创作主题的动画连续剧。故事承接了第一部和第二部的剧情。讲述了博士只做了3分钟“世界之王”，就立马被打回原形了。原来愿望之码一旦被激活，便可掌控自己的意愿，它告诉大家，要想获得真正的愿望，必须要比赛答题。答对1道数学题，可以实现1个3分钟的愿望，答对8道数学题，可以实现1个永久愿望。 由此，博士和罗克双方才开始真正的较量。国王、花花、依依、小强等荒岛伙伴能适应地球的新生活吗？罗克和UBIQ又会如何迎接新挑战，解除荒岛危机呢？而博士也拉拢了一个新帮手，博士经典的愚蠢阴谋功力会不会大增呢？摆脱各方控制的愿望之码，又将会有怎样令人称奇的表现？新危机，新挑战，新故事，一场全新的数学较量马上就要展开了。
现代化学系女大学生江语一觉醒来，发现自己身处异国。江语决定在异国圆自己的商业梦想，开始为了开商铺成为云启国首富不断努力，同时，她也遇到了许多小伙伴，而其中一个，似乎是微服私访的皇上，一段搞笑欢脱的孽缘就此展开！
在一次凤凰城赛车大奖赛期间，消失二十年的东方巨兽武罗再度现身，给城市带来了巨大的灾难和恐慌。武罗在袭击中受伤，躲进山洞休养。年轻赛车天才张小蚤，因过于自信，带领四人小队冒险偷袭受伤的武罗，反而引发了更严重的危机。面对打击，张小蚤在武器专家赖道张的帮助与激励下，不仅提升了战斗力，也找回了失去的自信。在武罗即将摧毁凤凰城的生死时刻，张小蚤挺身而出，力挽狂澜，成功拯救了全城，最终成为新一代的城市英雄。
在某个小岛上，有一个可以伪装成任何东西的廉价刺客，名叫伍六七。伍六七平时看上去是个理发师，其实背地里却做着刺客生意。他热爱理发事业，喜欢给人剪头发，善用剪刀——剪刀也是他的刺杀武器。由于初入刺客行当，行情十分廉价，因此接到的都是些奇葩的刺杀任务。在完成刺杀任务的过程中，他常与刺杀对象发生一系列有趣的意外事件，每次任务都被搞得乱七八糟。 伍六七其实是他的经纪人鸡大保从海边“捡”回来的，当时他重伤昏迷失去了记忆，没有人知道他的过去。鸡大保根据理发店门牌号给他取了个名字——伍六七，同时作为他的经纪人，以理发店为据点，替伍六七承接各种奇葩的刺杀任务。伍六七从来没有成功完成过刺杀任务，但却每次都能意外的化解雇主的仇恨。然而，由于从来没有成功刺杀过一个人，他的行情低落，只能混迹于刺客行业的底层，生活穷困潦倒。 在伍六七这个弱鸡刺客执行那些奇葩任务的过程中，他看到了很多人，经历了很多事。他开始渐渐的认清自我，身世之谜也渐渐浮出水面。慢慢地，也许有一天，他终将寻回自己失去的记忆。
现世与异界间因能量不稳定而产生的时空之隙，是身处异界的怪物们通往现世的唯一通道，为了阻挡怪物入侵，现世里，一群拥有特殊体质的天命之人，勇敢地站在时空之隙中为了守护世界而战。
在经历了“奇遇记”中的奇幻冒险之后，三毛得到了进一步的锻炼与成长，并增加了勇气与 智慧。三毛、小拉里、巧巧和小怪怪这四个小伙伴正在童话世界中过着幸福快活的日子，突然有一天，他们的平静生活被一件突发事件所改变。
