数学荒岛历险记3是《荒岛历险记》数学系列的第三部作品，是一部凝合了数学科普教育与少年励志为创作主题的动画连续剧。故事承接了第一部和第二部的剧情。讲述了博士只做了3分钟“世界之王”，就立马被打回原形了。原来愿望之码一旦被激活，便可掌控自己的意愿，它告诉大家，要想获得真正的愿望，必须要比赛答题。答对1道数学题，可以实现1个3分钟的愿望，答对8道数学题，可以实现1个永久愿望。 由此，博士和罗克双方才开始真正的较量。国王、花花、依依、小强等荒岛伙伴能适应地球的新生活吗？罗克和UBIQ又会如何迎接新挑战，解除荒岛危机呢？而博士也拉拢了一个新帮手，博士经典的愚蠢阴谋功力会不会大增呢？摆脱各方控制的愿望之码，又将会有怎样令人称奇的表现？新危机，新挑战，新故事，一场全新的数学较量马上就要展开了。
汉朝末年，董卓挟天子以令诸侯，战神吕布为其征讨，四方群雄并起。而大势决断，竟尽出一家之手，水镜门下八奇，谋冠天下。就在此时，一个神秘的刺客跟随他的商家主人悄然走进这个时代，牵出群英纷争，乱世无常……
在某个小岛上，有一个可以伪装成任何东西的廉价刺客，名叫伍六七。伍六七平时看上去是个理发师，其实背地里却做着刺客生意。他热爱理发事业，喜欢给人剪头发，善用剪刀——剪刀也是他的刺杀武器。由于初入刺客行当，行情十分廉价，因此接到的都是些奇葩的刺杀任务。在完成刺杀任务的过程中，他常与刺杀对象发生一系列有趣的意外事件，每次任务都被搞得乱七八糟。 伍六七其实是他的经纪人鸡大保从海边“捡”回来的，当时他重伤昏迷失去了记忆，没有人知道他的过去。鸡大保根据理发店门牌号给他取了个名字——伍六七，同时作为他的经纪人，以理发店为据点，替伍六七承接各种奇葩的刺杀任务。伍六七从来没有成功完成过刺杀任务，但却每次都能意外的化解雇主的仇恨。然而，由于从来没有成功刺杀过一个人，他的行情低落，只能混迹于刺客行业的底层，生活穷困潦倒。 在伍六七这个弱鸡刺客执行那些奇葩任务的过程中，他看到了很多人，经历了很多事。他开始渐渐的认清自我，身世之谜也渐渐浮出水面。慢慢地，也许有一天，他终将寻回自己失去的记忆。
上古十大神器“太一轮”，因在其刻上了“太白克太辰”，使得历史产生了巨大的变化。太白帝国由于量产“机关兽”，并用其强大的武力掌握了神州大地。但野心无垠，太白帝国为了追求比神州大地更辽阔的版图，意图取得天下。时为太白历99年。太白帝国疆土底下烽烟四起，天下各地都持续着帝国与反抗军的战斗。在用古代动力驱动的帝国“机关兽”面前，一名反抗军少女手持传说中神器之一“轩辕剑”挺身而出。而那时，少女的青梅竹马少年却沦为帝国的奴隶。命运使然，即使少年的聚落曾被袭击，他仍然无法自拔地深陷于机关术的魅力之中。在历经了生离死别各种造化之后，两人皆以为与对方生死相别却又重逢时，众人的命运，也尽被卷入了历史的滚滚浪涛之中。
新的一年，全新好玩的故事在青青草原上演，这一次的主角是“好吃懒做”的懒羊羊（梁颖 配音），他将和好朋友与新伙伴们做出一道道美食，和小朋友们度过快乐美味的时光。 羊村建成了新厨房，村长（高全胜 配音）做出了很多好吃的姜饼分享给羊羊们。懒羊羊夜晚偷吃姜饼，无意间打翻了调味盒，谁知竟导致灶台下滋味王国的剧烈动荡。来自该王国的上学五宝棒棒、健健、康康、欢欢和乐乐要寻找跑走的姑奶奶（严彦子 配音），因为姑奶奶掌控着王国的各种滋味。麻烦的是姑奶奶住进了灰太狼（张琳 饰）的家，根本不打算回去。无奈之下，懒羊羊只能和伙伴们构思各种各样的美食，希望姑奶奶能够满意地回到她的国家……
