该动画通过展现伏羲与恶劣的自然条件斗争，克服重重困难，最终带领族民走向繁荣昌盛，展现了中华民族自强不息的奋斗精神。
故事发生在一个名为魔仙堡的魔法世界之中，黑魔仙小月（周娇 饰）偷偷修炼黑魔法，还想要盗走魔仙彩石。守护魔仙小蓝（廖景萱 饰）为了追寻魔仙彩石的下落来到了人间，藏身于音乐盒中，偶遇了善良的姐妹凌美淇（孙圳 饰）和凌美雪（黄安仪 饰）。 小蓝住进了姐妹俩的家中，化身成为他们 的保姆，三人共同度过了一段充满了幸福和快乐的生活，彼此之间结下了深厚的友谊。魔仙女王（王慧 饰）特别准许小蓝教授两姐妹魔法，美淇和美雪成为了小魔仙，与此同时，小月亦在人间结识了名为严莉莉（刘美含 饰）的女孩，将她变成了小黑魔仙。在人间，一场正义和邪恶之间的战争即将拉开序幕。
传说在无烬道之塔里，有12枚强大的魔幻陀螺，它们形态各异，蕴含着神秘力量。如果坚定了心中的信念，摇动陀螺罐并发射，陀螺机械兽就会回应陀螺手的呼唤，在光辉中现身，与陀螺手并肩战斗。来自不同时空的12个孩子，与魔幻陀螺结下深深的羁绊，和魔幻陀螺一同玩耍、一同战斗、一同成长！跨越时空玩转陀螺，不容错过《魔幻陀螺6》！
