该片讲叙了虹猫、蓝兔在开心国的奇妙识字旅行。虹猫、蓝兔在一次野外识字游戏中，从一群蚂蚁手中救下了神奇的字魔方，他们得知字魔方要找回因蚂蚁国进攻而失散的字卡，决定帮助字魔方。一段寻字、识字的旅程开始了，开心国的小王子乐乐、蚂蚁国的小公主六六先后加入了虹猫、蓝兔的队伍。四个孩子克服了重重困难，终于找齐了以笔、墨、纸、砚四大字精灵为首的全部字卡。蚂蚁国也与开心国重修旧好，幸福和快乐又回到了这片土地上。
明日岛虽然鼓励创新，但新技术存在着很高的风险，同时明日岛也面临着很多自然灾害。面对各种危机，由代表科学（S）的赛拉斯、技术（T）的甜甜、工程（E）的爱迪、艺术（A）的阿力、数学（M）的曼妮莎和运动（！）的小金组成的超学先锋就会挺身而出，赶往救援的第一线。在塞拉斯的指挥下，队员们分工合作，利用各种科学知识解决各种麻烦。在处理危机的过程中，队员们可能会产生观点和行动上的分歧，但最后大家总能坚持团结合作精神，并找到解决问题的最佳方案。而人工智能百变校巴作为超学先锋的重要成员，也会变身各种工程车，助力救援行动。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
