故事主角之一春音艾菈（另译春音爱良）为了成为一个在Prism Show（一种结合歌舞﹑花式溜冰和绫镜跳跃的新型竞技运动）舞台上表现得光鲜亮丽的“Prism Star（绫镜舞者，即在Prism Show表演的舞者）”，便与她身边的两位主角之一天宫律舞（另译天宫律舞）、高峰美音一同迈向成为演艺圈明日之星的路程。
时值2007年的秋天，北原春希（水岛大宙 配音）是一位就读于峰城大学附属学园的平凡高中三年级学生，为了替自己的高中生活划下完美的句号，春希加入了轻音乐同好社团。可是，惨淡的经营让这个本就默默无闻的社团几近崩溃，春希的美好愿望眼看着就要破灭。 一次偶然中，正在独自弹奏吉他的春希突然听到一段美妙的歌声，追寻着这声音，一个名叫小木曽雪菜（米泽円 配音）的女生出现在了春希的面前。雪菜是学校里的偶像人物，之后，雪菜经由春希的邀请加入了轻音部。紧接着加入的是能够弹奏一手好钢琴的女生冬马和纱（生天目仁美 配音），和纱的叛逆和不羁人尽皆知，可即便如此，春希还是热忱地邀请了和纱“入伙”。
兵藤一诚（梶裕贵 饰）是学校里出了名的好色男，因此遭到了诸多女生的嫌恶，某日，一位名叫天野夕麻（生天目仁美 配音）的神秘美少女突然出在了一诚的面前，她不仅向一诚告了白，还提出了约会的请求。难道一诚的春天就要这样来临了？ 让一诚没有想到的是，在初次的约会之中，自己竟然被天野夕麻杀死了。原来，夕麻的真实身份是下级堕天使丽娜丽，她接受了教会的命令，专门前来刺杀一诚。就在一诚魂飞魄散之际，学园里的公认校花莉亚丝（日笠阳子 配音）出现在了他的面前，她使用恶魔棋子将一诚复活，并使其成为了自己的眷属。教会刺杀一诚的真实目的究竟是什么呢？一诚又将怎样面对死而复生的人生呢？
本剧以镰池和马所著的轻小说《魔法禁书目录》中的人气角色御坂美琴为主角的外传漫画《科学超电磁炮》改编。 故事发生在面积占据东京都西部的三分之一，居住着230万名人口，其中八成人口是学生的巨大都市“学园都市”。学园都市和外部隔离，研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发，并大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（Level 0）、低能力者（Level 1）、异能力者（Level 2）、强能力者（Level 3）、大能力者（Level 4）和超能力者（Level5）。故事从学园都市最强的电击公主“超电磁炮”御坂美琴，某天认识了和黑子一样担任风纪委员的初春饰利开始......
坐落于日本南方的丰饶岛屿南十字岛，某天夜晚，一位名叫津名志拓人的少年来到了这座岛屿上，这个独自从本土游来的少年，进入岛上的南十字学园高中部学习，性格开朗向上的他遇到了像扬卷和子、进藤须方等充满个性的学生并与他们深入交流。 但是，这个南十字学园隐藏着巨大的秘密，沉睡於地下的巨大人像“Cybody”。围绕着这二十多个巨像，人们都抱负着各自的秘密，自称“绮罗星十字团”的谜之秘密结社的暗中活跃，以及巫女们的歌声，还有拓人自身也抱有着巨大的秘密…… 以被蓝天大海包围的南国之岛为舞台，有爱情、梦想、友情的青春讴歌，现在就要开幕了。
