家族败落，至亲受难，罗征从云端跌落成为一名卑微家奴，在各族抗争不断、神秘力量统治的世界，不甘堕落的罗征偶得神秘功法，炼自身为器，一道抗争的序幕，就此轰然拉开。
灵气复苏，整个世界都被浓郁的灵气所覆盖，地球上的生物被此影响。人类开始觉醒，拥有更强的力量。人类以外的生物同样在灵气影响下飞速进化。一些强大而神秘的种族悄然崛起，传说位于力量顶点的便是——异皇族。机缘巧合，异皇族皇子的灵魂穿越附身在普通人类青年黄尚的身体……
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
《神兽金刚2天神地兽》是一部具有浓郁中国特色的原创国产动画。它以中国文化为背景,大量运用中国传统神话与经典著作《山海经》中的奇山异兽,充分表现神话人物性格特征,展现了中国悠久灿烂的文化和五千年文明历史,众多新元素的加入为全片增添了奇异瑰丽的中国色彩。故事讲述了用爱和正义遏制邪恶,邪不胜正的故事,告诉孩子们,爱和正义是不可战胜的,秉着寓教育于乐趣中的理念。
西岚为了改写魔界那场大战的结局踏上时空之旅，与一心寻找“鬼手”真相的鬼剑士天才结成盟友，共同历经了悲鸣洞穴，暗黑圣战以及天界革命等刻骨铭心的冒险旅程，最终呈现在他们眼前的，究竟是渴求已久的希望，还是更加严峻的挑战？能够改写未来的关键之人，究竟是谁？
故事以凹凸学园的初中部与高中部为舞台，描写围绕着刚升入高一的新生——金与他身边的同学之间，轻松有趣的搞笑向日常生活。 凹凸学园里有着形形色色性格各异、古怪却也不失可爱的学生，而本作采用平行式的单元小故事讲述，用萌系Q版人物、声优的诙谐演出及别具一格的画面效果，将最轻松真实的学园生活展现给观众。
