主角秦尘本是武域中最顶尖的天才强者，却遭歹人暗算，陨落大陆禁地死亡峡谷。必死无疑的秦尘，却意外触发神秘古剑的力量……三百年后，天武大陆偏僻之地，一位同名少年意外继承了秦尘的意志。作为大齐国军神定武王的爱孙，却因生父来历成迷，母子二人在定武王府中受尽冷遇，相依为命。为了重写望日的强者神话，也为了守护自己所爱的一切，秦尘毅然决然扛起维护天下五国的大任，再度踏上武道之路。
五十年前，江湖突然被 “混沌”入侵，慕容穹组建魔教对抗，艰难苦战不得胜利。神使易枝花降临，教会众人妖化功法成功战胜混沌。可神使离开，妖化功法传入江湖后失控，慕容穹失望退隐。他的手下余化冰趁机上位，改良妖化功法，竟创造出朋克真气时代，让江湖欣欣向荣，但代价就是江湖客们都变成了“上功怪“”。有着赤子心的少年东方胜，找到了归隐在向西饭店的慕容穹，想靠他恢复昔日江湖荣光，啼笑皆非的故事自此拉开帷幕……
《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
