2010年，超级大国“布里塔尼亚帝国”（Britannia）为了夺取日本的地下资源而侵略日本，在布里塔尼亚帝国强大的兵器Knightmare进攻下，日本在不到一个月的时间内被征服。日本被剥夺了自由、权利甚至是国家的名字，布里塔尼亚帝国将“日本”改称为“11区”，“日本人”这名词则被11这数字所取代。表面上看来布里塔尼亚帝国的统治似乎牢不可破，但其中早已出现了裂痕。 七年后的2017年，在生死边缘获得“Geass”的力量，立志要粉碎布里塔尼亚帝国的黑色皇子鲁路修，以及获得第七世代人型机甲兰斯洛特，立志从帝国内部进行改革的白色骑士枢木朱雀，影响了整个世界。
东京的某私立大学的法学院的入学生主人公・多田万里在前往新生入学说明会的路上迷了路，遇上同样迷路的柳泽光央，并成为朋友。之后在要前往新生入学说明会的路上时，遇上了一位手持一大束玫瑰花的美女。她将手上的那束玫瑰花殴打万里与光央的脸，并将花束丢给光央，告诉他“恭喜入学”后离开。原来她是光央的青梅竹马・加贺香子，并且与光央有婚约（香子单方面决定）。但光央却很讨厌香子。而过去高中时光央正是为了逃脱她，悄悄地、在香子不知道的情况下去报考这所大学。但事后还是被香子查觉，并报考与光央同样报考这所大学的法学系。 而这也成了万里与香子认识的契机。
在新季节里，三云队为了晋级A级以及选拔远征部队而参加B级等级战的时候，受到了近界最大军事国家阿富特克拉德命令的附属国加罗普拉出现，急袭本部。 从被绝密召集的边界精锐部队的迎击战中拉开帷幕。 从率领着大量特立恩兵的加罗普拉的进攻中，边境能守护本部吗！？ 随着动画的发展，动画世界也越来越热闹。
