神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
故事主要围绕在鸡（员工）、鹰（老板）、羊（女同事）、狗（男同事）四个主人公之间的工作生活展开。鸡小贱在上班途中总能遇到千奇百怪的琐事，导致上班迟到。通过诙谐幽默的动作及故事将动画与实拍相结合，故事贴近上班一族的日常生活，让上班族观看时找到共鸣。
