故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
渡劫期大修士陈凡陨落在天劫中，却一梦五百年重回地球的年少时代。回到地球时代的陈凡，决定踏踏实实重新学习，扎实根基，同时弥补之前的遗憾，帮助前世忘年交治好顽疾，并帮助同学渡过难关成功考学，最后找回自己的伙伴一起成长的故事。
星球在战之后的百年，白鸽岛一场简单的庆典。却引来了外星人争夺神秘石像的战争。毫无心理准备的白鸽岛顿时陷于惊慌失措之中。在现阶段的外星人统治下，原本相互为敌的几方人被迫在白鸽岛一起居住。外星人打着寻找自己各族隐匿在人类中的头叛徙的旗号，挑动人类相互怀疑残杀。而自己扮演一个救世主，从面而使人类在精神上屈服。在武力的胁迫下，无知的人们把自己的邻居——“外星人的叛徙”推上了断头台。少年天望，承受着同的屈辱，忍辱负重独闯阴阳之界去收集对付外星人的第七种元素，途中历尽生死磨难，灵魂与肉体倍受煎。在他的带领下，少年们与邪恶展开了殊死搏斗，以宝贵的生命，满腔的热血重塑了人类的尊严。
