顶级武者步惊云与聂风，为了应对一场将要席卷整个人间的浩劫，在无名前辈和神秘天外来客的帮助下变成量子态后，下落不明。三千年后，一颗小行星撞击地球，地表成为一片荒蛮的废土。 被困在地下的人类，逐渐发现在人体内存在著名为"脉能"的超能力量。 来自32号地下城的孤儿步天云，意外唤醒了沉睡在陨铁之中的步惊云，从此发现了自己体内的“脉能”潜力，并与聂风传人聂子风一起，走上了成为“脉能武者”的历练之路，为守护世界而战。
本季主要讲述了在始祖灵兽利用无尽能源替布莱克驱逐了体内的黑暗力量后，无尽能源便消失了，正当SPT 小队感到失望时，派特博士无意上发现了幻影金刚的芯片中记录着关于阿瑞斯水晶的传说… 于是战神联盟在SPT的协助下踏上了寻找阿瑞斯水晶的征途，在经历重重磨难，战神联盟终于扫平了阻碍，战胜了也想染指水晶的海盗和邪恶精灵，最终在一场公平的对决后，雷伊以实力最终赢得了阿瑞斯水晶，帮助赛尔们找回了无尽能源。
贞冠元年，人族以天璇为首的宗门之士，大兴方术，与异族之人各持两界，相互对立。 数年前，洛灵城中，有一条名为长安幻街的街道，因为异震的缘故，意外连通了两界，为了避免长安乃至整个洛灵城沦为两界交战的战场。住在此处的异人，一边同时做着两界的生意，一边小心翼翼的维护着此处连通两界的秘密。 人族少年顾少宁，在一次误打误撞之下，来到了长安幻街，并且结识了生活在这条街上异族之人。同时，少年原本平凡的命运，也因为发现了这条长安幻街的秘密，而发生了翻天覆地的改变。 命运之轮一旦开启，便只能推撵着少年不断的成长向前，却也因此，将他一步一步的卷入了宗门与异族争斗的旋涡之中.....
汉朝末年，董卓挟天子以令诸侯，战神吕布为其征讨，四方群雄并起。而大势决断，竟尽出一家之手，水镜门下八奇，谋冠天下。就在此时，一个神秘的刺客跟随他的商家主人悄然走进这个时代，牵出群英纷争，乱世无常……
本片前半部分讲述唐诗的故事，12星座人物以古装造型来表演，星猫作为串场人物。后半部分两个环节，第一个环节是星猫来解释古诗的意思，后一个环节为诗人沙龙。以寓教于乐的形式演绎了中国博大精深的诗词文化。
特别篇动画《秦时明月之罗生堂下》是独立于动画《秦时明月》正传剧情之外的短篇番外故事。该动画讲述少司命年纪轻轻就从阴阳家弟子成为了阴阳家五大长老之一的经历。
