一个是外表开朗内心敏感的作家，一个是外表稳重内心狂热的杂志社编辑，再度重逢的两人终于从过去的那场阴霾中走出来，有情人终成眷属。但生活并没有就此平静，从青春走向成熟，从校园走入职场，生活与感情中仍然会不断遇到一些新的问题，不善沟通的两人在面对与处理这些问题的过程中渐渐成长，真正走进彼此内心。
这是一个人类理所当然拥有超能力“个性”的世界。被称为「笨久」的“无个性”少年·绿谷出久与憧憬的No.1英雄欧尔麦特相遇，被其发现绿谷隐藏的英雄资质，从欧尔麦特手中继承了“个性” One For All。笨久进入了英雄辈出的名门高中·雄英高中，以成为用“个性”拯救社会和人们的英雄为目标，和同学们一起度过了充满考验的每一天。 虽然打倒了宿敌All For One，但欧尔麦特也用尽了力量，便从职业英雄隐退。笨久继承了他的遗志，拿到了「职业英雄临时执照」，又接近了“最棒的英雄”一步。这时，笨久遇见了雄英三巨头中的一位，在职业英雄夜目爵士手下进行校外实习的三年级学生·通形未吏生。其压倒性的实力，让笨久更加向往在职业英雄事务所参加可以真正进行英雄活动的校外实习。另一边，不安分的＜Villain＞团体·死秽八斋会的年轻头领解修师，与继承了All For One意志的敌人＜Villain＞联军首领死柄木吊进行了接触。之后，在解修师的身旁，出现了一位少女的身影。 笨久与英雄候补生们即将与新的 “威胁” 进行战斗，新的 “使命” 挑战也开始了！！
本作是超级机器人大战首次制成动画，故事背景在“OG2”结束后发生的“巴鲁多露事件”的原创故事。因为这是第一次动画化，机战迷都十分期待，但因动画素质低而不获好评。
故事的发生地是在一座名为星元市的小城市。 在市内的狮子尾山上，耸立着一个闪耀着彩色光芒的巨大物体，这个被命名为“摩诺之角”的物体，实际上是16年前“怪兽之日”事件发生之后就矗立在那里的“怪兽的角”。 在世界各地同时出现怪兽的“怪兽之日”事件发生之后，怪兽灾害开始变得日常。日本的地球防卫队开始以武力对付怪兽的同时，怪兽防灾科学调查所（统称SKIP Scientific Kaiju Investigation and Prevention center）也为了防止怪兽灾害的发生和受灾情况扩大，不断对各地区进行科学调查和避难引导。这个组织时至今日，还在不停地调查“怪兽之日”出现的原因和城市中的“摩诺之角”。 年仅7岁的“优马”在狮子尾山与父母露营时，遭遇了怪兽袭击，他奇迹般地生还并毫发无伤。以此为契机，“优马”踏上了研究怪兽生物学的道路。虽然有着痛苦的过去，但优马没有失去梦想，他依靠“想象的力量”成长起来，作为新手调查员加入了“SKIP”，被分配到了星元市分所。 就在这时，星元市发生了大规模的怪兽灾害。“想要保护眼前这些穷途末路的人们!”这个强烈而直接的想法从心底涌出的瞬间，“优马”的脑海中出现了儿时见过的光之使者“卢提昂”在和他说话：“我就是你，你就是我... ... 释放你的想象力!” 出现在手中的神秘之光包裹住优马的身体，释放出的想象之力将光与人结合在一起，守护未来的光之巨人“亚刻奥特曼”变身! 优马以及亚刻奥特曼与重要的伙伴一起，追逐着永不停歇的梦想，从现在开始奔跑!
再次相见的露易斯和才人。据才人所说，在森林中倒下时为一漂亮的妖精所救，总算是保住了性命。与才人的距离更近了一步的露易斯终于能够坦率的面对自己的心情 露易斯和才人受到安莉艾塔的命令和谢丝塔一起，踏上了寻找拥有不可思议力量的精灵之旅。旅途中，对于才人看待自己的心情感到不安的露易斯，渐渐对才人开始冷淡起来，于是两人的关系变得僵硬。终于在阿尔彼奥的森林中发现了金发的妖精少女缇法尼艾的露易斯一行，对于那个不可能听到的声音感到愕然。无意识的懒懒散散的才人终于惹怒了露易斯…… 由于在意决定来到学园的美少女缇法尼艾以及寄情于才人的谢丝塔，使得露易斯不能很好整理自己的心情。另外，连安莉艾塔女王都？！一方面是恋爱大混战的展开，另一方面看不见的敌人也慢慢的袭向露易斯……
