本作第1话的主要角色是爱佳，故事由她和贵明在图书室整理书库说起。两人为了克服彼此的异性恐惧而互相呼叫对方的名字，而结果是喜忧参半，此时，麻烦男雄二目睹了两人的暧昧行为，由此故事掀起了波澜……
高中毕业之后，北原伊织（内田雄马 配音）顺利的进入了大学，即将展开崭新的大学生活。为了上学，北原来到了一座坐落在海边的城市里，和内陆城市完全不同的海洋气候使得北原对未来的生活充满了憧憬和希冀，同时也使他开始接触潜水这项有趣的运动。 个性活泼开朗略微有些强势的古手川千纱（安济知佳 配音）、温柔体贴实际上对妹妹千沙充满了强烈的占有欲的古手川奈华（内田真礼 配音）、时常顶撞北原但其实对哥哥充满了兴趣的傲娇少女北原栞，在这里，北原很快就结识到了一帮志同道合的好友们。加入了潜水部的北原，又会在这项运动中找到怎样的意义呢？
从人类开始开发宇宙开始进入A.C.（After Colony）纪年，在第一个宇宙殖民地L1完成后百年，地球统一政府对殖民地以武力实行高压统治。 在A.C.165宇宙住民对地球圈发起抗争，而在其中的调停者是非暴力非武装份子的希罗·維，并在各殖民地和地上展开演说推广其理想，但其在A.C.175遭到暗杀（其中一种说法为杀手是OZ前身的特务组织的成员），随后殖民地陷入混乱并遭到特务部队（后来的OZ前身）镇压。之后在地球上提倡和平主义的山克王国和其王室匹斯克拉福特家族也遭消灭。 A.C.195年强力反对地球统一政府强力支配的殖民地份子，对地球送入了五架高达，开始歼灭特务部队OZ的“流星作战”（Operation Meteor）。
这是一个将艺术视为魔法的世界，每一年，星之森魔法艺术高中都会向世界各地输送大量具有魔法艺术家潜质的毕业生，他们会活跃在闪亮的舞台之上，给观众们带来快乐。爱咲小花（千本木彩花 配音）是学校里新来的转学生，盛大而重要的星之森夏日祭即将拉开序幕，初出茅庐的小花，竟然在误打误撞之中成为了祭典的实行委员。 外冷内热的一条寺帝歌（梅原裕一郎 配音）、特立独行沉浸在自己的世界里的墨之宫葵（大桥贤一郎 配音）、开朗元气的带刀凛太郎（小野友树 配音）、成熟圆滑的庵条瑠衣（羽多野涉 配音）、内向沉默的土笔茂音（苍井翔太 配音）、样貌可怕但内心却十分温柔的响奏音（江口拓也 配音），等待着小花的，是这六名有个各自独特风格的艺术家们，他们能够相处愉快吗？
《潘朵拉之心》的故事主角「奥兹贝萨流士」，在15岁的成人仪式上遭遇到血红般的灾厄，為了莫须有的罪名，奥兹跌入永远的黑暗牢狱「阿嵬茨」。在阿嵬茨裡奥兹遇到了被称之為「血染之黑兔」的「艾莉丝」，并藉著与她订下契约逃脱牢狱。之后奥兹开始追寻自己被使者判刑的理由，艾莉丝则追寻自己丧失的记忆。
