知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。 令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。
描述一只黑灰斑纹的小猫跟丢母亲又找不到回家的路，在筋疲力尽累瘫之际巧遇一个跌倒的小男孩，从此由男孩一家暂时照顾。因男孩家为禁止饲养宠物的公寓，一家人还得费尽心机不让邻居发现小猫的存在，只是偏偏一直找不到饲主又和小猫日久生情。在经历某些事情后，一家人终于搬到新公寓展开全新的生活。
在美国的国际宇宙开发研究所，对开发宇宙有着无比热情的年轻研究员·冲一也自愿接受成为行星开发用改造人·代号“Super 1”的改造手术。 但是，知道Super 1存在的黑暗国家·多古马王国要求把Super 1交给他们。之后，拒绝交出Super 1的研究所被多古马派出的怪人所摧毁，存活下来的一也决心与多古马抗争到底，但现在以他自己的力量还不能变身。 一也为了学习变身的奥秘而回到日本，拜赤心寺门下，学习赤心少林拳。半年后，经过地狱般磨练的一也终于掌握了变身成Super 1的技巧，并展开了与多古马的怪人战斗。
露比（斋藤彩夏 配音）是一只快乐的生活在魔法王国之中的宝石宠物，即将进入魔法学校就读的它却在一开始的入学测试之中就失败了，为了能够继续留在学校之中，露比必须潜入人间，找到那个独一无二的和自己心灵相通的女孩子，带着她一起进入学校深造。 就这样，露比来到了人间，并且顺利的邂逅了自己的真命天女樱明（高森奈津美 配音），除了这个天真可爱善良活泼的小姑娘外，露比还结识了很多的人类伙伴——沉默寡言却外冷内热的神内佑马（立花慎之介 配音）、个性孤僻实际上非常善良的阿鲁玛（高本惠 配音）和无论何时都能保持乐观的米莉亚（竹达彩奈 配音）。
